Если на счету лежат и рубли, и баты — какие деньги спишут?

В приложении вроде можно задать приоритет. Лучше уточнить в чате поддержки банка, как именно это настроить.

Карта ведь привязана к конкретному счёту. С него и спишут.

Любая валюта конвертируется через доллар. То есть двойная конвертация. Если покупаешь баты за рубли, банк сперва переведёт рубли в доллары, а уже затем на доллары купит баты.