А если хозяин электронно подал заявление в эмиграционную службу о временном пребывании, нужно все равно идти за справкой в эмиграционную службу? Пхукет

Справка тм30 сама вам не нужна. Если вам нужен резиденс сертификейт для покупки байка\сдачи на права\ открытия счета в банке - вот его уже нужно получать в иммигрейшн.