если из России летим одной авиакомпанией, а назад другой — так можно?

Если оба рейса регулярные — да ради бога.

Прилетаю чартером и остаюсь, а потом хз каким лучше способом — или регуляркой через Москву, или чартером через Казахстан, как и прилетела, но беру билеты туда-обратно, теряя перелеты.