Если рейс задержали, скажем, часов на 12. Трансфер, который должен приехать, столько ждать не станет, я думаю. Как тогда добраться до отеля?

А вы где трансфер бронировали? Если через отель — надо их предупредить, что рейс задерживается.

Обычно когда заказываешь трансфер, они просят указать номер рейса. И уже сами отслеживают, есть задержка или нет.