Чтобы в аэропорту при вылете получить vat refaund вся обувь должна быть обязательно в коробках ?

Без разницы. Можете хоть на себя обуть. Если это не люксовый товар, никто смотреть не будет. Если вы конечно не сто пар одинаковых везете