Если лететь через Бангкок и Самуи, паспортный контроль на Самуи проходить или в Бангкоке ?

Нет конечно. в бангкоке. как вы на внутренний рейс попадете без пограничного контроля.

В бкк паспортный контроль, потом отводят к гейту где есть только доширак, там ждешь самолет на самуи. В аэропорту самуи после пцр перед трансфером можно купить симку.