Если новый паспорт получил - пропустят в Таиланд по земле через Лаос? Штампов то в новом паспорте нет, но наверное у них в системе что-то показывает?

Ну база то биометрическая

Возьмите просто с собой старый паспорт аннулированный, и письмо из Посольства что паспорт 1 поменяли на паспорт 2. Если не поменяли, а второй хотите откатать, то можно попробовать поменять только на этапе второго въезда в Таиланд, потому что лаосцам действительно такое не очень нравится.