если обратный билет позже, чем через 45 дней (49), будут вопросы?

Не критично, в самом худшем случае заплатите небольшой штраф на пограничном контроле. Размер штрафа лучше уточнить на сайте миграционной службы Тайланда.

Вроде было 500 бат в день, в смысле за день после 45 суток.