Если я прилечу Аэрофлотом из Москвы, смогу ли улететь обратно тоже Аэрофлотом, но через Новосибирск? слышал, есть какие-то ограничения на обратный билет, если летишь регулярным/чартерным рейсом.

Прилетел регулярным — значит и обратно регулярным, то же самое с чартером.

У Аэрофлота сейчас в Таиланд все рейсы регулярные. Никаких проблем нет.

У Аэрофлота нет чартера, даже если огромными буквами написано, что чартер — это место в чартерном блоке, но рейс регулярный.

Если прилетел чартером, то должен улететь чартером той же авиакомпании, либо любым регулярным. Если прилетел регулярным — улетай хоть на метле.