Есть ли разница в каком банкомате в Пхукете снимать деньги, может ли различаться у них курс?

Нет. Они берут комиссию от 200 до 220 батт за транзакцию.

Снимайте в банке лучше, там без комиссии, не через банкомат.

Курс обмена при этом устанавливает ваш банк и платёжная система (Visa или MC)