Как, когда фамилия супруги отличается от фамилии ребенка (ребенку 2 года), тайцы будут в аэропорту спрашивать свидетельство о рождении по прилету?

Нет, у меня с ребёнком разные фамилии, ни разу не спрашивали. Только паспорт.

Свидетельство берите обязательно, спрашивать с большой вероятностью будут наши. В случае с двухлеткой - с очень большой вероятностью. Тайским пограничникам одинаково куда и чьего ребенка вы везете. Но это речь про выезд из РФ, на въезде и наши, наверное, ничего спрашивать не будут.