Может кто подсказать: в Ханое надо будет забрать багаж и снова зарегистрироваться, плюс терминал меняется, но билет куплен единый — пересадят ли на другой рейс из Ханоя в Фукуоку, если первое плечо (Москва-Ханой) задержат?

По идее должны, потому что рейс одной и той же авиакомпании. Гляньте маршрутную квитанцию, там номер билета должен быть, и он один на оба рейса

Естественно Всё, что покупается по одной брони/билету — значит авиакомпания обязана довезти вас из начальной точки в конечную