Кто-то летал Москва-Маскат-Бангкок-Самуи (единый билет) Oman Air? Мы багаж сдаем в Москве и получаем уже на Самуи, правильно я понимаю?

Да

Это зависит от того будет ли открыта регистрация на последний сегмент, обычно если в момент сдачи багажа в Москве до последнего сегмента больше 24 часов то скорее всего багаж придется получать в Бангкоке

Да. В зальчике международных прилетов.