В Scenia Bay менеджеры по жилью требуют предоплату за квартиру. Это вообще надёжно и так тут принято?

Обычное дело. Типа гарантия, что заселишься.

1. Убедись, что они реально "менеджеры Scenia" 2. запроси квитанцию.