Могу ли отдохнув на Фукуоке две недели, вылететь обратно. И через две недели примерно прилететь еще раз на Фукуок?

Второй раз по е-виза да.

Если вы про внутренние перелеты то вопрос по визе не стоит. Если вы вылетаете в другую страну - вам по возвращению опять поставят штамп 30дн на Фукуок или 15дн в сайгоне.