Можно ли сделать визу после того, как 45 дней уже прошли, если я нахожусь во Вьетнаме? Или надо заранее брать обратные билеты в Россию и только потом лететь?

Пока вы во Вьетнаме, визу оформить не получится — нужно выехать. Если вы гражданин РФ, виза вообще не требуется: выехать и сразу же заехать обратно даст вам ещё 45 дней