Можно ли второй загран использовать для поездок по Тайланду, если первый, по которому въезжал, лежит в иммиграшке?

А почему нет? Для Тайланда как государства второй загран — это уже другой человек.

А нафига вам загран для поездок внутри? разве что для перелёта на самолёте понадобится) вообще-то можно:)

Теоретически при перелёте сотрудник имигрейшн может глянуть печать о въезде или визу, и если во втором загране этого не окажется, попросит показать первый и подтвердить, что вы в стране легально.