Мы вынуждены перенести билеты из Таиланда на другую дату, и ближайшая нормальная дата на 2 дня после 45-дневноно штампа. Чем грозит такой оверстей, не будет ли проблем с визами потом? Или лучше заранее сделать бордер-ран?

Не будет, заплатите штраф на выезде. Или в миграционку за продлением на 7 дней.

Можете в миграшке на 7 дней отсрочку для выезда сделать (правда я не знаю платно это или нет). Штраф за оверстей 500 бат/день. Посчитайте каждую опцию и сравните. Бордер ран 2600 бат на чел.

Мы в такой же ситуации просто заплатили 1000 бат за оверстей. Решили, что так дешевле и меньше сложностей. Никто на нас волком не смотрел на контроле. Пригласили в отдельную комнату, поставили штамп, взяли деньги, и отпустили.