За чартер можно доплатить в аэропорту за перевес или дополнительный багаж отдельно?

Зависит от авиакомпании: где-то онлайн можно, где-то прямо в аэропорту. Но во втором случае как правило выходит дороже. Гляньте на офсайте АК. У Азура 30 кг багажа через сайт — 4400 руб, корзинка фруктовая — 1200 руб.