На Самуи требуют паспорт в залог за байк — это обычная практика?

Мы брали на таких же условиях

Нет. Паспорт в залог оставлять нельзя. Ни в коем случае. Если что-то случится — ты окажешься в худшем положении, потому что паспорт будет у них.