Если я в Таиланде, получится ли через сайт Аэрофлота докупить багаж и оплатить картой Мир?

Нет

Можно. Мы так делали. Позвонили в Аэрофлот, оформили доп багаж, они прислали ссылку на оплату. Спокойно оплачиваешь своей картой Мир