Впервые прилетел в Таиланд, буду 60 дней + продление 30, хочу в Малайзию на неделю и обратно на те же 90 дней. Проблемы на границе будут?

На 90 дней уже не вернётесь, второе продление только 7 дней дадут. На границе могут быть вопросы, но пропустить должны. Обратный билет, бронь отеля и деньги держите при себе или оформите турвизу в Малайзию (тогда сможете остаться на 90 дней во второй раз)