Что делать, если срок загранпаспорта истекает через 4.5 месяца? Можно ли вылететь из Вьетнама в Казахстан по загранпаспорту, а в Алматы пересечь границу уже с паспортом РФ?

Скорее всего да. Здесь при продлении нужно, чтобы паспорт был действителен ещё больше месяца до окончания срока, но повторно въезжать нельзя. А выпустить должны без проблем.