Подскажите, если беру билеты через одного провайдера типа Авиасейлс, то по прилёту в Бангкок иду по таможенной зоне прямо на самолёт до Самуи? Ведь это по сути единый билет.

Ага, у вас единый билет.

Если на сайте Emirates это единый билет, то весь паспортный контроль проходите на Самуи, а Бангкок — по транзитной зоне. Насчёт Авиасейлс не в курсе, вероятнее всего так же. позвоните в поддержку Emirates и уточните.