Подскажите по возврату НДС в Пхукете. Нужно в аэропорту в два места идти, до и после сдачи багажа?

Обязательно именно так. Сначала (почти на входе) в одно окошко, а затем, уже после контроля — во второе (напротив 15 выхода)