Скажите, если оформить электронный документ для Таиланда не за 72 часа, а за сутки, он на границе будет действителен?

будет

Можно даже по прилёту заполнить, но лучше заранее, чтобы время на границе не тратить. За сутки нормально

Хоть по прилёту оформляй.