Подскажите, пожалуйста, если срок действия паспорта остался 5 месяцев, могут быть проблемы с авиакомпаниями и въездом в Таиланд?

Нет. Только если кто то ступит.

При вылете вас могут не посадить на самолёт.

Если вы на срок до 90 дней (штамп) - все ок. Но лучше второй паспорт взять с собой. Вдруг затянет остров.