Подскажите , пожалуйста, как можно на букинге при бронировании отеля в Таиланде указать имена 2 отдыхающих, чтобы потом на таможне проблем не было?

Там при бронировании можно через запятую перечислить тех, кто будет проживать.

Таможню интересует только то, что вы с собой везёте, а не где будете жить.

На Букинге при покупке и потом при изменении сведений, есть опция указать гостя. В итоге номер будет выписан на человека бронирующего, а в качестве гостя указаны вы.