Кто знает, при покупке билета на паром до Пхи-Пхи с трансфером есть какие-то ограничения по расположению отеля? В описании про это ни слова. То есть забрать могут из любого отеля?

Имеется. Внимательно гляньте внизу

Если берёте с Пхукета, то как правило обычный билет с трансфером захватывает пляжи аж до Патонга на севере. Севернее (Камала и дальше) уже просят доплатить. Если едет несколько человек из Сурина, Банг Тао и т.п., может выйти дешевле вызвать такси от отеля до пирса и купить билет на паром вообще без трансфера, чем вносить extra fee.