Может, вопрос и тупой, но подскажите: оформляем евизу, летим с пересадкой в Хошимине, а конечная точка — Нячанг. Как правильнее в заявке указать город прилёта — Хошимин или Нячанг?

Зависит от того, где таможню будете проходить. Если это стыковка и ваш багаж сразу летит дальше, тогда пишите Нячанг. А если из транзитной зоны в Хошимине выйдете — то указывайте Хошимин.