Подскажите пожалуйста, можно ли заехать во Вьетнам по е-визе на 90 дней, после чего выехать подать повторно заявку, и заехать второй раз ещё на 90 дней. Если да, какие тонкости могут быть?

Можно. Тонкости - будете сидеть вне Вьетнама неопределенный срок от 5 до 20 дней пока не получите новую визу.

Конечно можно. Из тонкостей: это длительная синхронизация баз миграционной службы, которая рассматривает и одобряет Вашу визу, и базы пограничников, которые фиксируют, что Вы выехали. Из-за чего регулярно люди пишут о том, что они выехали, спустя небольшое подались на визу, а им ее возвращают на доработку с формулировкой: "Вы находитесь во Вьетнаме, пожалуйста, выехайте." Причём люди пишут, что если выезжать через аэропорт, то ситуация чуть лучше, нежели если выезжать через наземную границу. Один человек даже писал что ему месяц так возвращали. Помимо этого есть "помогалы", которые могут всего за 50 баксов помочь одобриться Вашей заявке на визу уже через пару часов, после выезда через наземную границу. Но на сколько легальны услуги таких "помогал", я затрудняюсь сказать, сам таким не пользовался. Еще есть абсолютно легальный кейс от пользователя когда за один выезд оформляется сразу две визы, чтобы потом при следующем визаране не ждать когда одобрят визу.