Подскажите пожалуйста, вьехали во Вьетнам без электронной визы, выезд стоит на 17.02, а билеты обратные у нас на 19.02. Будут ли какие то наказания/штрафы за два дня overstay?

Будут конечно. И дай бог, чтобы вы смогли решить это в порту. Могут просто не выпустить из страны и отправить в миграшку

Максимум заплатите штраф.

Идите с билетами и паспортами в имиграционку и говорите что Только на эту дату смогли купить билеты