У кого был опыт долгосрочной аренды жилья, при завершении договора проблем с возвратом депозита не возникает, если квартира целая? Или они придумывают проблемы на пустом месте?

Составляйте опись при приёмке и передаче. Так и должно быть при подписании договора.

Смотря какие условия. Если вы заключили договор не напрямую и сделали фото до заселения, то легче. Чаще «помогайки» или небогатые тайцы норовят содрать ещё денег.