После окончания первых 45 дней после приезда, я могу сделать заявку на визу и получить ещё 60 дней или только борден ран (в Камбоджу например)?

Визу (на 60 дней и потом продлить на 30) вы можете получить только за пределами Таиланда. В Консульстве. Либо самостоятельно, либо через компанию (купив визаран). Можете съездить просто на бордерна - тогда поставят еще один штамп на 45 дней.