Взяли билеты, а спустя 2 дня выяснилось, что жена беременна, а летать в первом триместре, насколько мне известно, нельзя. Вопрос такой: кто-то сдавал невозвратные билеты и как это вообще проходит?

Билеты на самолет? По медицинским показаниям вернуть можно. Лучше у авиакомпании уточнить. В любом случае справка понадобится, что ей летать запрещено, а не просто ваше желание

РФ компания?

Если будет заключение врача с противопоказаниями к полетам, то с ним можете обратиться. Но обычно, при хорошем самочувствии и здоровье женщины ничего страшного не случится)

Если брали не напрямую у перевозчика, а через агрегатор, то пишите туда или звоните, если телефон горячей линии есть