Скажите, если я улечу в Тайланд 29 апреля, то мне поставят штамп на 90 дней пребывания ?

Теоретически да. Другой вопрос, как это будет выглядеть. Те будут ли ставить по прилёту штамп на 90, либо же просто в миграционном центре нужно будет проставлять штамп на 30 дней каждые 30 дней.

Да поставят 90 дней.