Скажите, может ли возникнуть сложность, если я лечу Аэрофлотом на Пхукет, а оттуда в Дубай (пока не знаю чем)? На что обратить внимание при покупке билета? Какие сложности с чартерами могут быть?

Никаких проблем. Я прилетал на Пхукет регуляркой, Этихад. Потом полетел в Дубай Эмирейтс. Через несколько дней полетел обратно на Пхукет Катаром (кстати они спрашивают на регистрации обратный билет из Тая), потом через несколько дней улетел из Пхукета в Южную Корею Korean Air. Никаких проблем не было на контроле ни разу.