Скажите, по e-vise во Вьетнам есть ограничения на аэропорт вылета? Указал везде один аэропорт, а вылететь хочу из другого, все ок будет?

Всё ок будет.

Писали, что есть аэропорты, которые не работают с е-визой. Вроде как были кейсы оболомов на этот счёт.

Если аэропорт, из которого вы фактически улетаете, не работает с системой е-виз как например Далат, то вас не выпустят из него, вашу евизу там не закроют. Проверьте, есть ли аэропорт, через который хотите вылететь, в списке на сайте оформления е-виз.