Подскажите, если на 45-й день нахождения во Вьетнаме я уеду в Куала-Лумпур, пробуду там 3 дня и вернусь в Нячанг — меня точно снова впустят на 45 дней?

Точно.

можно вообще сразу за границей развернуться и обратно зайти)))

Да, если паспорт РФ и раньше не было нарушений миграционных правил Вьетнама, то точно впустят. Хоть в тот же день.