могу ли я взять обратный билет на 45 дней. но в целом если улечу из страны на 40-й, то по прилёту назад в Тай отсчёт дней обнулится и пойдёт с первого?

Верно )

Прилетели - вам 45 поставили, вылетели - аннулировали его, прилетели - ещё 45 поставили, и на каждый прилёт должен быть обратный не позже 45 дней.