Я с двумя гражданствами, у меня украли русский паспорт, по которому я въезжала, но паспорт второго гражданства ( чешский)

Только новый загран российский. По чешскому вас не выпустят из Тая, потому что вы не по нему въезжали. Теоретически можно было бы попробовать получить СНВ и по нему полететь с пересадкой в каком-нибудь КЛ, а там "поменять" паспорта. Но афаик по СНВ можно только прямые рейсы. Для стран, с которыми нет прямого авиасообщения могут сделать исключение, но Тай не тот случай.