Забронировала гостиницу через букинг, он пропустил бронь по действующей мастеркарт тинькофф. Бронь подтвердили, а получится ли снять деньги с моей карты?

Если не заплатите отелю наличкой при заселении, то может быть)

Нет. Букинг разрешает бронировать с привязанными ранее российскими картами мастер/виза, но списать оплату они не в состоянии. И если у вас предоплата, то бронь может отвалиться. Напишите в отель через букинг и предупредите заранее, что оплатите при заезде и чтобы бронь не аннулировали.